强大的国防军是以色列国家安全三大支柱(国防军、全民性预备役及动员体制、高效的情报部门)中最关键的一个，这支强大的国防军是在以色列相对完善、高效的国防与军队指挥体制控制之下来完成作战、训练等任务的，那么，以色列的国防与军队指挥体制是一种什么样的结构呢?

以色列最高军事决策机构是国防委员会(安全内阁)，其成员有总统、总理、国防部长、外交部长、内政部长、财政部长、交通部长、邮电部长、总参谋长及若干特别顾问等，国防委员会讨论决定有关国防的一切重大问题，如建军方针、作战计划、军队体制编制、武器装备的生产与采购、同国外签订军事协定等。总理担任国防委员会主席兼武装力量最高统帅，战时，成立以总理为首的战时内阁，全权处理与战争有关的重大事宜，成员由总理为首的战时内阁，全权处理与战争有关的重大事宜，成员由总理确定，一般包括国防、外交、财政、交通和邮电部长，以协调政府各部之间的活动，此外，内政部所属的各类警察部队也受国防委员会的领导，担负一定的国防任务，由国家情报总局(摩萨德)和治安总局(辛贝特)组成的国家情报系统为国防委员会的决策提供情报支持，在总理办公室之下还设有一个反恐局，负责协调和指挥反恐怖行动。

以色列的最高军事执行机关是国防部，国防部长为文职，行使军队总司令的职权，直接掌握军队的指挥权，一般由退役的高级将领担任，国防部长下设有由部长任命的总务长官，统管和指导国防部的具体业务工作，总务长官下设的总务副长官、主任科学官、军事工业协调官，是总务长官的辅助参谋，协助总务长官工作，以色列国防部下属的一般业务部门有预算、财务、审计、人事、安全、保密、基建、军品出口、装备采购与生产、国防科研发展、后勤管理、编制控额及数据等局、署，此外，国家紧急状态委员会也编制在国防部的组织序列中。国防部主要负责兵力动员与补充、军费开支、军工生产、国防科研及武器采购、占领区的军政管理等军事行政业务，国防部办公厅主任在部长、副部长的领导下主管该部的日常工作，国防部与国防军的业务分工很明确，国防部担任行政领导和技术支援，国防军负责“专业性”事务，如军事训练、士气培养，尤其是军事作战计划的拟定和实施等军事业务，但是，由于国防部长处于军队最高统帅的位置上，所以他也有权过问所有的军队事务，包括那些纯专业性事务在内。